目的:本研究使用长链非编码RNA(lncRNA)测序和生信分析的技术筛选发生侧颈淋巴结转移(LLNM)的甲状腺乳头状癌(PTC)组织中发生差异表达的lncRNAs,探讨其在PTC发生LLNM的潜在功能,为早期诊断PTC发生LLNM提供理论依据。方法:严格遵循纳入及排除标准收集了3例发生LLNM的PTC患者的癌组织和癌旁组织,通过lncRNA测序技术检测其lncRNA表达谱,分析发生差异表达的lncRNA。预测差异表达倍数大于2倍的lncRNA的靶基因,然后对其进行GO分析和KEGG富集分析。通过量化观察差异表达倍数最高的lncRNA对淋巴管的长度和分支数的影响,验证其对淋巴管生成的影响。结果:1.在发生LLNM的PTC组织及癌旁组织中存在大量差异表达的lncRNAsQ-VD-Oph作用,共筛选出8589个差异表达的lncRNAs,其中4782个表达上调,3807个表达下调。2.以FDR<0.05且|log_2FC|≥1为标准,筛选PTC组织中发生显著差异表达的lncRNAs,得出PTC组织中有2632个发生显著差异表达的epigenetic readerlncRNAs,其中1221个表达明显上调,1511个表达明显下调。差异倍数最大的lncRNA是表达显著上调的lncRNA SLC26A4-AS1,其次是表达显著上调的lncRNA H19。3.预测PTC组织中发生显著差异表达的lncRNA的selleckchem Tamoxifen靶基因,发现393个具有靶基因的lncRNA,其中包括lncRNA SLC26A4-AS1和lncRNA H19。4.通过聚合酶链式反应(qPCR)检测lncRNA SLC26A4-AS1在人类正常甲状腺细胞系Nthy-ori3-1和甲状腺癌细胞系TPC-1、SW579、B-CPAP的本底表达,结果表明lncRNA SLC26A4-AS1在TPC-1中表达最为显著。5.敲低TPC-1中的lncRNA SLC26A4-AS1后,完整淋巴管的长度和分支数显著减少,与未处理的TPC-1组对比,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:1.发生LLNM的PTC组织及癌旁组织中存在大量差异表达的lncRNAs。2.Lnc RNA SLC26A4-AS1在PTC组织中的表达显著增高,其可能通过促进淋巴管生成进而促使PTC发生LLNM。