基于生物信息学分析KDM1A在肝癌组织中的表达及意义

目的分析KDM1A在肝癌组织中的表达及意义。方法:通过KM-plotter网站分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因表达数据库(GEO)收集的肝细胞癌(HCC)组织及肝血管瘤旁正常肝组织中的RNA测序数据,比较KDM1A在HCC及正常肝组织中的表达及其临床意义;通过收集本院HCC免疫组织化学石蜡切片60例,正常肝组织20例检测KDM1A的表达水平,并分析其表达水平与HCC患者临床病理特征之间的关系,通过Kaplan-Meier分析KDM1A表达水平与HCC患者的生存关系。结果TCGAHTEMPO-mediated oxidationCC数据集分析显示KDM1A在HCC中的表达较正常肝组织高(P<0.01);免疫组织化学检测KDM1A在HCC组织中亦呈现高表达状态(P<0.01);生物信息学分析KDM1A与HCC患者的生存期相关,KDM1A高表达者总体生存期(OS)、无复发生存期(RFS)、无进展生存期(PFS)、疾病特异性生存(DSS)较KDM1A低表达者差(P<0.01);KDM1A高表达与HCC患者肿瘤大小、微血管侵犯、TNM分期有关。HCC患者中KDM1A高表达者此网站较KDM1A低表达者OS更(P<0.01)。结论KDM1A高表达为HCC患者预后TGF-beta/Smad抑制剂不良的影响因素之一。