目的 分析银川市2016—20JQ122年引起手足口病的柯萨奇病毒A6型(CV-A6)VP1的基因特征，为手足口病的防治工作提供有效的参考依据。方法 收集2016—2022年银川市手足口病所有CV-A6核酸呈阳性的标本进行病毒分离培养，应用一步法聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增其VP1区完整基因核酸片段进行核苷酸序列测定，利用测序结果进行系统发育树构建、同源性分析及氨基酸突变位点分析。结果 2016—2022年银川市共分离到手足口病CV-A6型毒株90株，测序后成功获得CV-A6 VP1区全长序列的毒株83株。完整VP1区基因均由915个核苷酸组成，编码305个氨基酸。系统发育分析显示，2016—2022年银川市83AZD2281抑制剂株CV-A6分离株均属于D3基因亚型的D3a分支；同源性分析表明，银川市83株CV-A6分离株与原型株Gdula株(AY421764-USA-1949)之间核苷酸相似性为82.1%～84.1%,氨基酸相似性为76.2%～80.5%,遗传距离较远；银川市83株CV-A6分离株与原型株Gdula株的VP1区氨基酸序列比较发现32个氨基酸位点出现变异。结论 2016—2022年银川市手足口病83株CV-A6分离株均属于D3基因亚型的D3aHepatocyte apoptosis分支。加强对CV-A6的持续监测及基因特征分析，对科学防控CV-A6引起的手足口病及其疫苗研发具有重要意义。