目的 了解境外新冠病毒全基因组特征和变异情况，及时发现境外流行新冠病毒变异类型，为云南省边境州市制定针对性的防控策略提供科学依据。方法 2021年11月，采集与云南省瑞丽市接壤的缅甸3例BLZ945新冠病毒感染者的鼻咽拭子样本，提取核酸进行病毒全基因组测序，以新冠病毒武汉株Wuhan-Hu-1(NC＿045512)为参考序列进行比对分析。结果 成功从3份样本中获得长度为29 881 bp、29 852 bp、29 875 bp的新冠病毒全基因组序列，基因组覆盖度为99.90%、99.87%、99.99%，分别检出39个、40selleck MS-275个、45个碱基位点突变，涉及28个、26个、28个氨基酸变异，非同义突变占66.1%(82/124)，以ORF1ab基因占比最高，达37.medical staff8%(31/82)。序列比对显示3个境外感染者的病毒序列与云南同一时间监测的病毒基因组序列高度同源，系统发育树显示3个境外感染者和瑞丽本土疫情病例聚成一簇。结论 3个境外新冠病毒感染者的病毒均属Delta变异株（B.1.617.2进化分支），未监测到其他类型变异毒株。瑞丽市本土疫情的持续传播可能与边境人员和缅甸病例直接或者间接接触有关。