1994-2021年广东省AFP病例中EV-A71的流行及其分子特征

为更全面了解广东省本地EV-A71的流行情况以及分子特征,本研究收集了1994-2021年广东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis, AFP)监测中分离获得的EV-A71毒株,使用Excel软件统计1994-2021年AFP病例中EV-A71的检出情况,PCR扩增肠道病毒的VP1全长基因片段并测定基因序列,使用BioEdit、iqtree等软件对EVA71进行分型与进化关系分析。本研究共获得119株EV-A71毒株,广东省EV-A71的检出率总体呈先上升后下降的趋势,2010年AFP病例中EV-A71的检出率达到最高,2017年后未从AFP病例样本中检出EV-A71。EV-A71病毒的VP1序列全长891bp,编码297个氨基酸,未见氨基酸插入或缺失。119条EV-A7selleck1 VP1序列核苷酸相似性为95.9%(88.4BLZ945体内%,100%),氨基酸相似性为99.3%(97.3%,100.0%),均属于EV-A71 C4亚型,其中1994-2001年AFP中分离的EV-A71毒株均为C4b亚型,2004年后流行的EV-A71毒株为C4a亚型。在22位点上,2007年后H取代Q成为22位点上的主要氨基酸,并在2008年出现22R突变;在289位点上,1994年开始出现289T突变,2009年开始,289A(57.1%)取代289T成为优势突变,并于2010年开始出现289V突变。掌握EV-A71随时间迁移的分子遗传进化特征,有利于为EV-A71感染的防控提供科学medial oblique axis依据。