不同沙藏时间人参种子转录组分析及差异基因筛选

分析人参种子休眠解除过程中基因表达谱的变化情况,并筛选其差异基因,为解析人参种子休眠解除机制提供依据。以低温沙藏不同时间的人参种子为研究材料,利用转录组测序技术进行比较分析。转录组共获immunocorrecting therapy得80.97 Gb Raw reads和80.19 Gb Clean reads。主成分分析和相关性分析表明基因在不同发育时期具有不同的表达模式且存在显著差异。可视化集合图显示有46 248个unigenes在四个时期共表达,有414、445、400和389个unigenes分别在低温沙藏0、8、14和28天特异表达。基于基因本体数据库功能注释显示差异表达基因主要参与不饱Empagliflozin体内实验剂量和脂肪酸生物合成进程、核质体和氧化还原酶活性等。基于京都基因与基因组百科全书数据库代谢途径显示差异表达基因主要参与过氧物酶体、蛋白激酶信号通路-植物、植物激素信号转导、核糖体、不饱和脂肪酸的生物合成、植物生理节律等代谢通路。人参种子休眠解除过程中需要不饱和脂肪酸生物合成和植物激素信号转导等多个生物过程的协同调控,构成复杂的休眠解除调控网络。不同沙藏时间人参种子转录组分析及差异基因的筛选,为解析人参种子休眠解除机制、开展人参分子Adavosertib配制育种奠定基础。