东亚与西方型幽门螺杆菌菌株感染原代胃癌细胞的转录组学分析

比较、分析和验证幽门螺杆菌（Helicobacterpylori）东亚与西方菌株感染原代胃癌细胞后的差异表达基因（differentiallyexpressedgenes，DEGs），探讨东亚和西方菌株的致病差异。用幽门螺杆菌东亚菌株GZ7、西方菌株26695以MOI50:1感染原代胃癌细胞6小时，收取细胞进行转录组学测序，以|Log_(2)FoldChange|>1，校正P值≤0.05为标准，筛选DEGs，利用Omicsbean-Cancer在线工具对DEGs进行生物信息学分析。选择4个重要基因进行TCGA数据库分析及Westernblot验证。东亚菌株GZ7感染胃癌细胞组与未感染胃癌细胞组比较有31个DEGs；西方菌株26695感染胃癌细胞组与未感染胃癌细胞组比较有Tamoxifen109个DEGs；西方菌株26695感染组与东亚菌株GZ7感染组之间共有22个DEGs，东亚菌株GZ7感染组特有DEGs9个，西方菌株26695感染组特有DEGs87个。DEGs主要参与炎症、细胞黏附、细胞表面受体、NF-κB和TNF信号通路以及脂类与氨基酸代谢等过程。Westernblot实验证实幽门螺杆菌感染上调胃癌细胞中JUN和FOSL1（转录因子）、IL6、DKK1（东亚菌株特有DEG）蛋白表达；下调细胞中JUN基因可以抑制IL6Soluble immune checkpoint receptors和DKK1的表达，东亚菌株GRepSox采购Z7再感染能够恢复细胞中JUN、IL6和DKK1的表达水平。TCGA数据库分析发现IL6和DKK1在胃癌组织中表达显著高于正常组织（P<0.001），且IL6和DKK1高表达与胃癌患者10年生存率负相关（P<0.01）。总之，东亚、西方幽门螺杆菌菌株感染胃癌细胞产生的DEGs有明显差异，可能是东亚、西方国家胃癌发病率差异的原因之一。