抗生素滥用导致自然界耐药性致病菌日益增多,随着时间的推移加剧了人类与动物感染疾病死亡的风险。因此,挖掘安全、天然和经济的抗生素替代品迫在眉睫。目前,多项研究表明益生菌可以作为抗生素的替代品广泛应用于农业养殖领域。益生菌能够帮助家禽提高生长性能以及饲料的利用率,通过定殖在家禽肠道内还能有效改善和维持家禽肠道菌群的生态平衡,是对家禽极为有益的一类活性微Dorsomorphin MW生物。其中,鼠李糖乳杆菌作为可以耐受机体消化道酸性环境的一类益生菌,可以实现在宿主肠道环境中的定殖,且能起到调节机体肠道菌群、提高免疫力等作用,基于以上的优越特性而广受研究人员关注。该菌在宿主体内分泌相关代谢产物能够抑制致病菌的增殖,促进有益菌的繁殖,其发挥的益生作用不容小觑。本实验以鼠李糖乳杆菌CLK101菌株为研究对象,对其进行基因组分析与注释,初步了解该菌株益生性能的遗传基础;并从南丹瑶鸡体内开展研究,探讨鼠李糖乳杆菌对瑶鸡的生产性能、脏器的相关指数、血清免疫的指标,还有肠道多样性等方面的影响,探究鼠李糖乳杆菌在瑶鸡饲喂过程中造成的影响,可为健康养殖南丹瑶鸡提供研究基础。主要研究内容如下:(1)基于Nanopore三代测序技术平台和二代测序技术平台对鼠李糖乳杆菌CLK 101进行全基因组测序,得到了一条大小为2,937,234 bp、GC含量为46.7Crizotinib化学结构1%、共编码2851个基因的完整环状染色体,共预测到61个t RNA和15个r RNA。通过对其基因功能的注释和分析表明,与碳水化合物的运输和代谢有关的编码基因数量最多;同时还包含了粘附蛋白、免疫调节等相关的益生基因。研究结果显示鼠李糖乳杆菌CLK101含有与遗传及代谢相关的基因,及菌株特异性的基因。进一步证明了鼠李糖乳杆菌CLK101是一株拥有潜在益生特性,并具有良好安全性的益生菌。(2)鼠李糖乳杆菌CLK 101在体内的益生特性评估,以1日龄南丹瑶鸡为研究对象,进行体内实验评估。饲喂21天后,两组饲喂鼠李糖乳杆菌(1×10~6cfu/g、1×10~7cfu/g)的南丹瑶鸡体重显著高于金霉素组和空白对照组(P<0.05),饲喂鼠李糖乳杆菌对瑶鸡消化酶活性均有一定程度的影响,说明鼠李糖乳杆菌可以帮助南丹瑶鸡更好的吸收和消化饲料,改善生长性能;饲喂低剂量鼠李糖乳杆菌的绒毛长度/隐窝深度的比值高于空白对照组,表明鼠李糖乳杆菌对瑶鸡肠道发育和生长具有促进作用;饲喂鼠李糖乳杆菌还可以提高南丹瑶鸡的机体免疫力和肠道黏膜屏障保护功能,对南丹瑶鸡的免疫及抗炎反应起着重要的作用。(3)采用16S rDNA测序的方法对对照组,抗生素组及两组饲喂不同浓度鼠李糖乳杆菌CLK 101的南丹瑶鸡盲肠的菌群进行测序。门分类水平上,优势菌均为厚壁菌门、疣微菌门、变形菌门、拟杆菌门和放线菌门;属分类水平上,低浓度鼠李糖乳杆菌显著上升了欧鲁森氏菌属这种可以利用糖类的益生菌的相对丰度,而高浓度鼠李糖乳杆菌则显著提升了艾克public health emerging infection曼菌属这类可以分解多糖的益生菌相对丰度;因此饲喂不同浓度的鼠李糖乳杆菌能显著提升南丹瑶鸡肠道对糖类物质的代谢能力,调节瑶鸡肠道微生物菌群平衡。综上所述,本课题利用基因组学技术对鼠李糖乳杆菌CLK101的基因组进行注释分析,随后再结合动物养殖实验评估其体内的益生特性及安全性。结果表明该菌作为抗生素的替代品可以提高南丹瑶鸡的生长性能,提升免疫水平。最后本研究证实了该菌的益生功效,说明鼠李糖乳杆菌CLK101在农业养殖中具有良好的应用前景,也为健康养殖瑶鸡提供了良好的理论价值和实践指导意义。