为了从分子水平上探究新疆帕米尔牦牛群体的遗传多样性、亲缘关系，为帕米尔牦牛种质资源的保护与利用提供参考依据，该研究以克孜勒陶牦牛、布伦口牦牛、吉根牦牛、哈拉峻牦牛、库兰萨日克牦牛、苏木塔什牦牛等6个帕米尔牦牛类群的111头牦Airborne microbiome牛为研究对象，测定牦牛mtDNA D-loop区序列，分析其多态性，构建系统进化树。结果表明：帕米尔牦牛mtDNA D-loop区序列长度为895～916 bp,共检测到111个变异位点，其中单态突变位点36个，简约信息位点75个；在111头个体中共检测出33种单倍型，平均单倍型多样性(H_d)、平均核苷酸多样性selleck激酶抑制剂(P_i)分别为0.9206、0.02613;6个类群间平均遗传距离为0.027,哈拉峻牦牛与克孜勒陶牦牛间遗传距离最小(0.019)。以上结果表明，帕米尔牦牛具有丰富的遗传多样性，苏木塔什牦牛、哈拉峻牦牛是较纯的牦牛类群，其它牦牛类群在进化过程中出现PCI-32765相互交流的情况。