基于Oncomine和TCGA数据库分析肌球蛋白10在头颈部鳞癌中的表达、意义及分子机制

目的：通过生物信息学方法分析肌球蛋白10(MYO10)基因在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的表达、意义及分子机制。方法：下载TCGA数据库中HNSCC样本的基因表达数据集，寻找差异基因并用基因集富集分析（GSEA）软件分析MYO10可能作用的信号通路。收集Oncomine数据库中MYO10表达在HNSCC中的研究，进行荟萃分析，并利用该数据库及Kaplan-Meier在线分析对MYO10在HNSCC中表达及预后进行验证。使用CPTAC、HPA在线数据库分析MYO10蛋白表达水平，使用ESTIMATE数据库、EPIC数据库探究MYO10表达和肿瘤免疫浸润的关系。使用Maftools R包、CompSCH727965使用方法lexHeatmap R包探究了MYO10表达与肿瘤基因组异质性和突变景观的关系。结果：对TCGA数据库中519例HNSCC癌组织样本及44例癌旁样本进行分析，MYO10在HNSCC中显著高表达（P<0.000 1）。对Oncomine数据库中的9项有关MYO10表达的HNSCC研究进行分析，MYO10在HNSCC中表达有差异（P<0.05）。生存分析发现，高表达MYO10的患者总生存期较低表达组显著降低（P<0.05）。免疫浸润相关分析显示，MYO10与多种免疫细胞浸润显著相关。GSEA分析显示，高表达的MYO10可能通过激活黏着斑激酶（FAK）、调节细胞骨架蛋白及Wnt信号通路、抑制氧化磷酸化、核糖体等信号通路发挥作用。结论：MYO10在HNSCC中高Ceralasertib分子量表达，HIV (human immunodeficiency virus)其高表达可通过抑制免疫浸润、激活或抑制某些信号通路影响HNSCC患者预后，该基因有望成为治疗HNSCC的一个新靶点。