以沙棘优良品种 ‘实优1号’ 为材料,对其叶片进行转录组测序,利用MISA和Primer 3(version Bafilomycin A1临床试验2.3.4)对获得的序列进行SSR位点挖掘和引物设计,以收集的42份沙棘品种为研selleckchem GDC-0973究材料,开展PCR和毛细管电泳检测,旨在开发一套多态性高、稳定性好、通用性强的EST-SSR引物,构建沙棘指纹图谱,从而实现沙棘品种的快速准确鉴定,并进行沙棘品种间亲缘关系分析。‘实优1号’ 转录组测序共获得6,196个SSR位点,其中,重复基元类型为182种,SSR基序长度主要分布在10~21 bp,占全部SSR的81.58%,主要SSR重复类型为单核苷酸重复(48.72%)、二核苷酸重复(22.68%)和三核苷酸重复(18.85%)。筛选出的28对引物在42份品种中共检测出193个等位基因,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、Shannon信息指数(I)等遗传多样性参数的均值分别为6.964、3.495、0.617、0.671、0.623、1.384。UPGMA聚类分析表明,42份沙棘品种间的遗传相似系数为0.601~0.990,当相似系数为0.694时,品种分为2组;当相似系数约为0.7402时,品种分为3组。优选6对引物构建的指纹图谱,可以实现沙棘品种的快速准确鉴定。本研究为沙棘的良种鉴定、指纹图谱构建、遗传多样性及亲缘关系分析等方面提供分子水平的理论基reactor microbiota础和数据支撑。