基于计算机模拟的丹参中黄酮类化合物抗肿瘤活性筛选

目的 运用计算机辅助药物设计对丹参中黄酮的抗肿瘤活性进行虚拟筛选。方法 于2021年12月至2022年3月,使用Sybyl软件的Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力,筛选活性VX-445半抑制浓度化合物;根据Lipinski五法则,使用Discovery Studio 2019 Client的Filter by Lipinski模块进行类药性预筛选评估;并进行ADME更多T(吸收,分布,代谢,排泄,毒性)预测;将筛选出的最优化合物与靶点蛋白进行Biacore体外结合测试,利用分子对接预测化合物与靶点蛋白的相互作用模式。结果 二氢丹参酮Ⅰ、新隐丹参酮和丹参酮Ⅵ与肿瘤靶点蛋白结合函数分值>7,并表现合理的类药性质,即具有较高的结合能gut micobiome力和良好的类药活性,二氢丹参酮Ⅰ最优。分子对接显示,二氢丹参酮Ⅰ与ADP-核糖基化因子样2受体的氨基酸残基精氨酸61(ARG61)以氢键结合。结论 筛选出丹参中黄酮类化合物二氢丹参酮Ⅰ表现很强的类药性,与ADP-核糖基化因子样2受体结合响应值高。