基于生物信息学探讨中药调节软骨细胞铁死亡干预膝骨性关节炎的用药规律

目的:探索中药调节软骨细胞铁死亡干预膝骨性关节炎的用药规律。方法:通过GEO、FerrDb数据库及Hisat2、DESeq2IACS-10759使用方法和R软件获取软骨细胞铁死亡差异靶点并进行富集分析。基于ADME指标及Lipinski规则,通过TCMSP数据库检索差异靶点所对应的化合物和中药,运用cytoscape 3.9.1软件构建潜在靶点、候选化合物及中药的网络,进行网络拓扑分析。对中药性味归经及治疗作用进行统计,分析用药规律。运用AutoDock Vina将核心化合物与关键靶点进行分子对接,评价其对接结合效能。结果:获取60个软骨细胞铁死亡差异靶点,富集分析显示主要通路集中在铁死亡、缺氧诱导因子-1 (hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路、破骨细胞分化、白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路等。其中13个差异靶点可以匹配到化合物,筛选得到993个潜在化合物,386味中药。性味归经统计显示,干预软骨细胞铁死亡的中药寒温并重,以苦、辛、甘味药为主,主要归肝、肺及脾胃经,治疗作用以清热、补虚和活血化瘀为主。RNA biology分子对接结FG-4592研究购买果均显示对接良好,所有结合效能(Affinity)值均小于-5.00 kcal /mol。结论:本研究发现中药骨碎补、半枝莲、丹参、延胡索等通过多成分、多靶点干预软骨细胞铁死亡,具有较强的调节作用,为深入研究中药干预膝骨性关节炎中的铁死亡提供了一定思路与方向。