目的 探讨不同中医证型2型糖尿病患者肠道菌群差异。方法 选择住院2型糖尿病患者200例，按中医证型分为阴虚热盛证40例、湿热困脾证33例、气阴两虚证103例、阴阳两虚证24例，同时选取健康体检者26名作为健康对照更多，收集临床资料，采集血清标本测定糖脂代谢等指标，采集粪便标本采用16SrRNA高通量测序技术进行测序。采用R3.4.1软件分析肠道菌群组成和Alpha、Beta多样性指标，并进行差异性分析，使用LEfSe方法挖掘不同证型标志肠菌并分析与临床指标相关性，PICRUSt预测肠道菌群功能变化特征。结果T2DM各证候组厚壁菌门与拟杆菌门的比例均低于健康Protein Tyrosine Kinase抑制剂对照组。与健康人群相比，T2DM患者肠道菌群多样性降低（P<0.05），湿热困脾证肠道菌群多样性最低。Venn图分析发现T2DM气阴两虚证有70个独有OTUs，阴虚热盛证、湿热困脾证和阴阳两虚证独有的OTUs分别是13、4和8个。MRPP分析显示T2DM不同证候肠道菌群结构组间差异大于组内差异（P<0.05）。属水平物种显著性差异分析显示，4种证候之间具有统计学差异的菌属共有16种。LEfSe分析显示在T2DM的4种rapid immunochromatographic tests证候中，阴阳两虚证多样性最突出，拥有8种代表菌，其次是气阴两虚证及阴虚热盛证，各有2种代表菌；代表菌与临床指标相关性分析显示与病程、BMI、脂代谢指标等存在相关性；湿热困脾证贯穿糖尿病全程，与各证型存在重叠，无代表菌群。菌群基因功能预测也证实4种不同证候肠道菌群功能在糖类物质代谢和氨基酸代谢等途径存在差异（P<0.05）。结论 不同中医证型2型糖尿病患者存在菌群结构差异，可能影响着糖尿病病程进展及不同中医证候的发生、发展及结局。